肝胆科
肝胆胰脾外科原为普通外科的一部分，年批准为硕士学位授权学科,年从普通外科独立出来，成为一个专业性很强的科室。年批准为博士学位授权学科。年成为博士后流动站。历过三十年、几代人的辛勤耕耘，目前是国家重点培育学科，全军器官移植中心。
肝胆外科共有张病床，开展了肝移植、肝癌、胆道胰腺疾病、肿瘤、胆结石等方面治疗及研究，以收治肝、胆、胰、脾外科疾病和腹部巨大肿瘤为主，年手术量余台，80%以上为大手术，目前在肝胆胰脾疾病、腹部巨大肿瘤等的诊治及相关实验研究方面均达国内先进水平。
消化外科
消化外科的前身是胃肠外科,医院普通外科中分离出来而建立,并在年和消化内科一医院。年科室被国家教委和国务院学位委员会批准为博士学位授权学科,年被中国人民解放军总后勤部及卫生部批准为全军器官移植中心,年被国家教育部批准为国家级重点培育学科。科室近年来承担多项国家计划、计划、国家自然科学基金,发表SCI论文数十篇。科室现有病区3个,开设床位张,教授4名,副教授9名,主治医师3名,3个病区的专业方向鲜明。第一病区的专业方向为食管、贲门疾病的诊治,临床特色为食管癌和贲门癌的微创手术治疗。
甲乳外科
甲乳血管外科原为普通外科的一部分，后独立建科。年被授予硕士学位授权学科,年获得博士学位授权学科。学科建科20余年，现有病区2个，病房设有病床张，其中高等病床20张，展开床位张。所有病房均是空调环境，“全天侯”收治病人。学科科研学术研究方向以甲状腺乳腺肿瘤和周围血管疾病的系统与序列诊治为专业特色。在国内外同行业中享有相当的声誉。
近年来学科加大科研创新力度，学科建设力求突出特色，每年都有新技术及新业务开展。在乳腺癌保乳手术、MEMOTO粗针穿刺技术微创切除乳腺良性肿瘤、乳腺癌新辅助化疗新辅助内分泌治疗、乳腺癌淋巴化疗、乳腺腔镜手术；甲状腺腔镜手术；下肢深静脉血栓系统治疗、超声辅助下血管腔内治疗等新技术。在乳腺癌、甲状腺疾病、周围血管疾病的诊治方面均居于全国领先地位。
骨科
骨科由著名骨科专家陆裕朴教授于年回国创建，是国家级重点学科、国家教育部“工程”重点建设学科、“长江学者奖励计划”特聘教授岗位设置学科、国家卫生部药理基地临床研究学科。
年，西京骨科搬入00平方米的新病房专科大楼，医院。学科设置全面在四肢创伤、显微外科、手外科、脊柱脊髓周围神经损伤、关节外科、微创骨科（关节镜、椎间盘镜）、脊柱畸形矫治、小儿骨科、骨肿瘤等领域均处于国际先进、国内领先水平。先后获得国家科技进步二等奖4项，国家教学成果二等奖1项。“超前思维，创新发展，建成国际骨科联合体与具有国际竞争力的知名学科”是未来5年学科的发展方向与目标。
整形外科
整形外科由我国整形外科创始人之一的著名整形外科专家汪良能教授创建于年，是全国最早成立的整形外科之一。年开始招收硕士研究生，年被批准为博士学位授权学科，是临床医学博士后流动站组成学科。目前医疗技术水平和医疗规模在全国处于领先行列。目前有医生25人，其中教授（主任医师）5人；副教授（副主任医师）6人，主治医生（讲师）7人。博士研究生导师2人，硕士研究生导师2人。医生中有多人先后在美国、英国和日本留学，绝大多数具有博士学位。
有普通门诊和美容门诊各一个，其中在建的美容门诊面积超过平方米，设有两个病区，开设专科病床80张，设有独立的专科手术室，展开手术床9张。分为：器官再造、创伤修复、皮肤肿瘤、颅颌面、瘢痕、乳房整形、美容等7个专业组。拥有国内最先进的各种专科医疗设备，包括进口内窥镜、吸脂机、微型电锯、手术显微镜、激光美容仪、高频美容仪等大型医疗设备。在耳、鼻、手指、阴茎、阴道和乳房等体表器官再造，烧（创）伤后瘢痕，各种皮肤外伤，颅面外科、美容外科、皮肤肿瘤、皮肤软组织扩张术，和内镜整形外科方面形成了自己的医疗特色，处于国内领先水平。
泌尿外科
泌尿外科是在我国泌尿外科创始人之一曹晨涛教授以及著名泌尿外科学家于茂生教授亲自领导下创始于上世纪50年代中期，该科是西北地区同行业中规模最大、门类最齐全的学科，现有床位80张，科室设有普通泌尿外科病房、肾移植病房、微创治疗中心病房、血液透析室、体外碎石中心、肾移植组织配型实验室、尿动力学检查室、男科学实验室等。科室设备齐全，拥有体外震波碎石机、泌尿系检查床、前列腺汽化电切仪、腹腔镜、输尿管镜、膀胱镜、尿流动力学检查仪、YAG激光、半导体激光、绿激光、钬激光等一系列泌尿外科专用检查及治疗仪器。自年在西北地区开展首例同种异体肾移植以来，建立了完整的肾移植配型试验室和泌尿外科透析中心，每年开展肾移植40-60例，肾移植病人和移植肾的存活率在国内处于领先水平。多脏器联合移植是科室的强项，已成功开展胰/肾联合移植，肝胰肾联合移植，腹腔镜活体亲属肾移植手术。于年1月在国内率先开展了肝肾胰联合移植，为世界第6例肝肾胰联合移植，是目前亚洲术后存活时间最长的肝肾胰联合移植。
神经外科
神经外科于年由我国著名的神经外科学专家涂通今教授创建，是新中国最早成立的神经外科单位之一。该科与神经内科和心身医学科共同组建了“空军医院”，开设床位张，形成了具有较大规模的临床神经科学中心。学科开设床位张，含4个病区，1个22张床位的ICU单元，并有6个专科手术室和独立的麻醉系统。配有欧美和日本等国家的Zeiss、Leica、Olympus手术显微镜、Brainlab神经导航仪、蛇牌神经内窥镜、SonopetCUSA、Diamed半导体激光刀、PLA-1电磁刀、CRW、岛津立体定向仪、RFG-3CF射频仪、Bird呼吸机、Sony术中脑干诱发电位仪、GE、Phillips多功能生理监护仪等先进仪器设备。经过多年的探索和积累形成了以下诸方面的学科特色：
1.颅脑创伤基础与临床救治研究。
2.中枢神经系统肿瘤发病机理与诊治研究。
3.立体定向与功能神经外科研究。
4.脑血管疾病的微侵袭手术与介入治疗。均达到国内外先进水平。
心脏外科
诞生于20世纪50年代的心血管外科，经过众多专家教授的不懈努力和探索，已发展成为人才梯队和专业结构合理，医、教、研总体实力国内领先、在国内外享有盛誉的国家重点学科、博士后流动站。年6月成功开展了我国第一例体外循环心脏直视手术，是我国心脏外科发展史上的里程碑。医院心血管外科面积00余平方米，包括三个住院病区（床位张），监护病区（床位30张），独立的专科手术室（6间）以及心血管病研究实验室平方米，成为集心血管病门诊、病房、监护室、手术室、实验室、影像诊断、介入治疗为一体的心血管病外科诊治和科研中心。
科室现拥有世界一流齐全的仪器设备和几十年丰富经验的医疗、麻醉、监护技术队伍以及多学科协作班子，常规开设婴幼儿及新生儿心脏外科、微创心脏外科、心脏瓣膜外科、儿童复杂先心病外科、心脏移植外科、冠心病及大血管外科等，每年在心血管外科完成各种心脏病治疗近例，其中重症复杂手术占65%，最大手术年龄为83岁，最小为生后3天，手术成功率为98.3%以上，国内领先。一般房、室缺手术成功率近%，国内领先，医医院为最低。
周一至周六全教授门诊，天随时联系入院和电话咨询，最短时间内安排手术。外科治疗范围：冠心病，动脉瘤，先心病，心脏瓣膜病，心脏移植，心脏微创美容手术，心衰治疗，房缺、室缺和动脉导管未闭的介入封堵治疗，动脉瘤介入治疗，各种心血管疾病检查和心脏手术后的住院复查。
皮肤科
皮肤科成立于年5月。半个多世纪以来，历经几代人艰苦卓绝的奋斗，成为国内学界梯队最合理、力量最强的科室之一。医院皮肤科医疗水平国内一流。在白癜风、银屑病、恶性黑素瘤、血管瘤、痤疮、黄褐斑、水疱病、性病、自身免疫性疾病和变态反应性疾病等方面的诊疗形成特色专病门诊。科室拥有国际一流的激光美容中心、性病诊治中心、过敏原检测中心、光疗中心。科室目前承担的课题总数和金额位居全国皮肤科学界前列，在学术科研上保持着国内领先地位。近十年的发展学界瞩目，先后成为博士学位授予学科、陕西省省重点学科，是国内皮肤科学界四个国家级重点学科之一,也是西部地区惟一的国家级重点学科。自年始先后被评为“践行三个代表”先进单位、学习成才先进单位。
耳鼻喉科
耳鼻喉科创建于抗日战争时期，年由著名耳鼻咽喉科学专家姜泗长院士担任主任，、年分别被国家教委和国务院学位委员会批准为硕士和博士学科，年被批准为临床博士后组成学科。年9月1日经空军军医大学训练部批准，科室正式更名为耳鼻咽喉—头颈外科。目前学科下设两个病区，三个专业组，拥有现代化专科门诊、手术室、实验室、听力中心、临床解剖培训中心和睡眠中心。科室面积约平方米，开展床位87张。在临床方面，科室以耳显微外科、耳神经外科、人工耳蜗植入、颅底外科、鼻内窥镜外科、头颈肿瘤、喉显微外科和鼾症外科为重点，手术范围涵盖耳鼻咽喉—头颈外科各个领域，并逐渐形成了耳鼻咽喉—头颈外科微创手术的临床特色。
眼科
眼科创建于年，是集医疗、教学和科研为一体的眼科专科，医、教、研整体能力处于国内前列，在国内、外享有较高知名度。目前为国内唯一的国际眼底病专家学会(ClubGonin)会员单位，中华医学会眼科学会及其眼底病学组和眼视光学组的组成单位，是陕西省医学会眼科学分会主任委员单位。目前医疗设备总值万元，有玻璃体切割超声乳化一体机、多种眼用激光机、眼底造影成像系统、准分子激光及波前相差仪、眼用超声诊断工作站、光学相干断层扫描仪和小儿眼底检查系统RetCAMⅡ等国际先进的专科设备;在复杂眼外伤救治和玻璃体显微手术、眼底病的诊治、准分子激光手术和视光学矫正、白内障超声乳化和人工晶状体植入、青光眼诊治、眼科整形美容、眼部肿瘤和眼眶手术、眼表疾病诊治和角膜移植、葡萄膜炎的检查和治疗和视觉功能评价系统等方面已形成我科特色;在眼内细胞增生及调控、眼外伤的实验和临床研究、眼内新生血管的防治、白内障的病因和防治研究、以及角膜移植排斥机制和角膜工程等科研方面具有明显特色和优势。已与德、美、英、日等国的著名眼科中心建立了密切的学术联系，并聘请多名国际知名专家为客座教授。
妇产科
妇产科始建于年，我国著名的妇产科专家王荣光教授为学科奠基人，经过几代人辛勤耕耘，学科不断发展壮大，成为具有雄厚实力、专业齐全、技术先进、享有声誉的学科。现为中华妇科肿瘤学术培训陕西分中心，国家药品临床研究基地，全国“医院”单位。妇产科具有实力雄厚的军医大学作依托，医院及妇产科本身的优势，成为进行临床医学与基础研究的坚实基础。在妇产科疑难重症、妇科肿瘤、高危妊娠内外科合并症处理方面达到国内先进水平。
学科专业齐全，具有特色，有产科、肿瘤妇科、普通妇科、专科门诊、实验室五部分。年门诊量,余人次，年住院4余人次。学科拥有一支学术水平高、临床经验丰富、治学严谨的学科队伍。
心内科
本学科成立于年。年被批准为全国首批硕士学位授权点；年被批准为博士学位授权点；年被国务院授权成为临床医学博士后流动站组成学科；年被批准为国家介入性心脏病学培训中心，同年成为亚洲急救中心，国际救援中心指定抢救小组成员单位；年成为国家“工程”重点建设学科；年被确定为世界健康基金会冠心病诊疗培训中心；年被确定为国家卫生部心血管疾病介入治疗培训中心。经过50年的建设和发展，本学科目前已经成为国内最大的心血管疾病诊治中心之一。展开床位张，其中重症监护病床20张。年门急诊量7万人次以上，收容8余人次，年完成各种心血管疾病介入手术8,余例，成为集影像诊断、药物治疗和介入治疗为一体的心血管病医、教、研中心。学科拥有主系列人员35人，其中教授7名，副教授13名，讲师18名，博导2名，硕导4名，年招收博士研究生8～15人，硕士研究生10～20人。
肾内科
肾脏内科目前已建成拥有门诊、病房、血液净化中心、专科实验室及肾活检病理诊断集医疗、教学、科研于一体的现代化肾脏病专业科室，博士学位授权学科。本学科是国内最早开展血液透析、腹膜透析和肾活检的科室之一，在西北地区率先建立了临床-病理-实验室相结合的肾脏疾病诊断体系，临床-病理-治疗相结合的肾脏疾病治疗模式，在诊断与治疗肾小球疾病、肾小管-间质疾病、慢性缺血性肾脏疾病和肾功能不全方面形成优势，是西部地区综合实力最强的专业科室之一。本中心特色：个性化透析-专家会诊-宣教的综合治疗体系。
血液内科
血液科为博士学位授权学科，是国家临床药物试验基地及卫生部认可的异基因造血干细胞移植及采集中心，也是台湾慈济骨髓库西北地区唯一供髓单位。病房设有正式编制床位80张，百级层流病房5间，配备有专用干细胞采集室。每年门诊患者0余例，住院收容余例，急性白血病占70%。实验室由骨髓细胞及组织学病理室、分子生物学及免疫学实验室、溶血及出凝血检查室、造血干细胞分离及培养室等组成。每年完成骨髓检查5余例。学科拥有较完善的恶性血液病病分子诊断平台，配备荧光显微镜2台（其中1台安装有FISH及常规染色体核型资料的分析软件）、流式细胞仪1台、定量PCR仪1台等基本设备。本学科在年就建立了自体骨髓造血干细胞移植与高温体外净化技术，是开展骨髓移植工作最早的单位之一。自年以来，完成亲缘/非亲缘HLA相合异基因造血干细胞移植、单倍体相合造血干细胞移植治疗难治、复发等高危血液肿瘤余例（每年约25-30例）。其中非亲缘异基因造血干细胞移植与单倍体相合造血干细胞移植均为西北地区首次。目前，正应用FISH检测多发性骨髓瘤和慢性淋巴细胞白血病细胞遗传学异常,为血液系统肿瘤患者实施个体化治疗，取得良好的临床效果。
内分泌科
内分泌代谢科于年在原第二内科内分泌学组的基础上发展而来。科室现有4人分别担任中华医学会糖尿病学分会常委、中国医师学会内分泌代谢医师分会常务委员、中华医学会内分泌学分会委员；中华医学会陕西内分泌学会、西安内分泌代谢病学会、陕西省医糖尿病学会等多种学术团体的副主任委员、常委等职。是中华内分泌代谢杂志、中国糖尿病杂志、糖尿病之友杂志医师版编委单位。科室长期立足于内分泌代谢疾病的医疗与科研，尤其在糖尿病、甲状腺疾病的诊断与正规治疗方面具有全新的理念和业绩，对下丘脑、垂体、肾上腺、甲状旁腺、胰岛等其它内分泌腺体疾病以及痛风、低血糖症、高脂血症、肥胖症等代谢性疾病也有较高的诊治水平，居全国先进水平。现有床位43张，年收容量人次以上，年门诊量40，人次以上。本科的临床内分泌实验室可开展多种内分泌激素测定。本科室拥有胰岛素泵20余台、动态血糖监测仪等设备；于年和年分别举办了西北地区及全国胰岛素泵学习班，交流介绍科室应用胰岛素泵与动态血糖监测联合应用治疗糖尿病的先进经验。
呼吸内科
呼吸内科在国内同行中享有较高的知名度，科室设备精良，医术精湛，治学严谨，精益求精。年成为国家临床药理研究基地，年成为陕西省哮喘防治协作组组长单位。学科带头人曾分别担任中华医学会呼吸病分会常委、陕西省医学会呼吸结核分会主任委员等职务。科室配备了德国JAEGER肺功能仪、高级进口无创及有创呼吸机、日产电子支气管镜、多功能床边监护仪、心电监护、除颤器、中央监护站等先进设备。精优的医护团队，贴心的服务理念，先进的仪器设备，为精准、快速的诊疗效果提供了重要保障。在急性肺损伤、重症肺炎、哮喘、慢性阻塞性肺疾病、肺癌、肺间质纤维化及肺血管栓塞等呼吸系疾病的诊断与治疗方面，科室积累了丰富的临床经验，并形成鲜明的医疗特色。年科室的门诊量达人次，住院人次，床位使用率为.0％，抢救危重病人人，治愈和好转率达到97.22％。此外，科室还积极拓展临床高新技术，为提高疑难患者的确诊率、改善生活质量和延长存活时间提供了崭新手段。其中包括经皮肺穿刺活检、肿瘤病灶微波毁损、气道支架植入、肺癌的放射性支架内照射、胸腔镜下胸膜与肺疾病的诊治、内科肺减容等，为晚期肺癌及阻塞性肺气肿患者带来了福音。
消化内科
消化内科成立于年,年被国家卫生部批准为国家临床药理基地,年被社会国家教育部批准为长江学者奖励计划特聘教授岗位学科。消化内科选择了我国死亡人数最多的恶性肿瘤――胃癌为研究方向，在发现胃癌新抗原MGAgs，制备其抗体，克隆其基因，特别是用其建立了先进的胃癌早期诊断方法等方面做出了令国际上注目的研究成果。消化内科重视国际学术交流，主持和举办了2次大型国际性会议，每年互派学者开展科学研究，经常邀请国外的从事消化病学专家，来该科进行学术交流报告。
神经内科
神经内科始建于年，与共和国同龄。病房现有床位张，分为四个病区，已形成了以重症监护、脑血管病诊治、癫痫监护和神经系统疑难病诊治为主的特色。在国内较早开展脑血管病介入和溶栓、脑出血颅内血肿穿刺术、免疫吸附技术等治疗，在神经系统疑难病和危重病的诊治与抢救方面在国内具有先进水平。重病监护病房（N-ICU）成立于年初，现有16张床位，医院中规模最大、设备最好的N-ICU病房。ICU的收容对象主要是危重神经系统疾病，如危重脑血管病、重症肌无力危象、癫痫持续状态、脑炎等。年平均收治危重病人余人次，为危重病人提供了高质量、高技术的治疗及护理。癫痫诊疗中心成立于年，设备包括：32-导脑电视频长程监测系统七台，16-24导脑电录像24小时动态监测系统四台、32通道睡眠呼吸脑电图监测二台。为病人的诊断、治疗及观察提供了脑电图的可靠依据，同时新增的脑电发生源定位等高新技术，对癫痫病人的术前病灶定位有着重要的作用。我科门诊日门诊量平均余人次，在西北地区乃至全国享有较高的声誉。
门诊已形成五大特色，分别是：
①脑血管病诊疗和咨询；
②癫痫的诊治和咨询；
③遗传性神经系统疾病的诊治和咨询；
④老年性痴呆和帕金森病的诊治和咨询；
⑤头痛、眩晕和睡眠障碍的诊治和咨询。
现有临床和实验室主要仪器设备总价值0余万元，目前主要开展的诊疗技术有：重心平衡检查和治疗、远程脑电监测、多导睡眠、脑电地形图、彩色多谱勒超声脑血流检测（TCD）、诱发电位肌电图检测、脑脊液细胞学、生化和病毒学系列检查，脑出血颅内血肿穿刺术、脑血管疾病介入诊断治疗术、肌肉活检术、神经活检术，肌电生物反馈治疗以及神经系统免疫疾病特异性免疫吸附治疗等。
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